樣品對投射或者反射光有部分的吸收，從而照相所得到的圖像上面的樣品條帶的光密度就會有差異。光密度于樣品的濃度或者質(zhì)量成線性關(guān)系。根據(jù)未知樣品的光密度，通過于已知濃度的樣品條帶的光密度指相比較就可以得到未知樣品的濃度或者質(zhì)量。這就是圖像分析系統(tǒng)定量的基礎(chǔ)。采用技術(shù)的紫外透射光源和白光透射光源使光的分布更加均勻，zui大限度的消除了光密度不均造成的對結(jié)果的影響。

    凝膠成像系統(tǒng)應(yīng)用范圍

    總體上來說凝膠成像系統(tǒng)可應(yīng)用于：凝膠成像系統(tǒng)可以用于：蛋白質(zhì)、核酸、多肽、氨基酸、多聚氨基酸等其他生物分子的分離純化結(jié)果作定性分析。

    （1）分子量定量

    對于一般常用的DNA膠片,利用分子量定量功能,通過對膠上DNA Marker條帶的已知分子量注釋,自動生成擬合曲線,并以它衡量得到未知條帶的分子量。通過這種方法所得到的結(jié)果較肉眼觀察估計要準(zhǔn)確很多。

    （2）密度定量

    一般常用的測定DNA(脫氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)濃度的方法是紫外吸收法,但它只能測定樣品中的總核苷酸濃度,而不能區(qū)分各個長度片段的濃度。利用凝膠成像系統(tǒng)和軟件,先將DNA膠片上某一已知其DNA含量的標(biāo)準(zhǔn)條帶進(jìn)行密度標(biāo)定以后,可以方便的單擊其他未知條帶，根據(jù)與已知條帶的密度做比較，可以得到未知DNA的含量。此方法也適用于對PA GE蛋白膠條帶的濃度測定。

    （3）密度掃描

    在分子生物學(xué)和生物工程研究中,zui常用到的是對蛋白表達(dá)產(chǎn)物占整個菌體蛋白的百分含量的計算。傳統(tǒng)的方法是利用的密度掃描,但利用生物分析軟件結(jié)合現(xiàn)在實驗室常規(guī)配備的掃描儀或者直接用白光照射的凝膠成像系統(tǒng)就能完成此項工作。

    （4）PCR定量

    PCR定量主要是指，如果PCR實驗擴(kuò)增出來的條帶不是一條，那么可以利用軟件計算出各個條帶占總體條帶的相對百分?jǐn)?shù)。就此功能而言，與密度掃描類似，但實際在原理上并不相同。PCR定量是對選定的幾條帶進(jìn)行相對密度定量并計算其占總和的百分?jǐn)?shù)，密度掃描時并對選擇區(qū)域生成縱向掃描曲線圖并積分。